Frygten for, at ebolaudbrud ville sprede sig til større by, er blevet virkelighed, oplyser ministerium.
Myndighederne i DRCongo oplyser, at man har registreret et tilfælde af ebolasmitte i millionbyen Mbandaka.
Det oplyser landets sundhedsminister, Oly Ilunga, i en erklæring sent onsdag aften lokal tid.
Spredningen til Mbandaka betyder, at ebolaudbruddet er gået ind i "en ny fase", skriver ministeren i sin erklæring.
Verdenssundhedsorganisationen WHO meddelte forleden, at man har forberedt sig på "det værste" i forbindelse med det aktuelle udbrud af ebola.
Frygten er hidtil gået på, om smitten ville spredes til en større by.
Det har WHO's vicegeneralsekretær for nødberedskab, Peter Salama, tidligere oplyst.
Det vurderes, at virusset allerede har kostet 23 mennesker livet i DRCongo, og med spredningen til en stor by bliver udbruddet sværere at begrænse, oplyser WHO.
Organisationen oplyste i sidste uge, at den har modtaget 4000 doser af en vaccine mod ebola.
Vaccinen gives dog på forsøgsbasis, og Peter Salama oplyser, at den er svær at anvende og altså ikke er noget vidundermiddel mod smitten.
I sidste uge blev risikoen for en spredning i regionen vurderet til at være moderat. Ni nabolande er blevet advaret.
- Hvis ebola spredes til en by af den størrelse (som Mbandaka, red.), så får vi et meget stort udbrud. Så venter en reel udfordring, sagde Peter Salama i sidste uge.