Uroen fortsætter på Tempelbjerget, hvor palæstinensere frygter, at jøder får held til at bygge et nyt tempel.
Israel har lørdag morgen besvaret raketangreb med bomber over Gazastriben, hvor israelerne har ramt to træningslejre tilhørende den militante palæstinensiske gruppe Hamas.
Der er ingen meldinger om tilskadekomne.
Angrebene kommer efter en blodig fredag med sammenstød mellem israelske sikkerhedsstyrker og palæstinensere både i Jerusalem og på Vestbredden.
Hamas havde erklæret fredag for "vredens dag" efter den seneste tids konflikt ved al-Aqsa-moskeen.
Vreden udspringer af, at jødiske højrefløjsgrupper har planer om at opføre et nyt tempel på Tempelbjerget.
En palæstinensisk gruppe, som støtter den ekstremistiske gruppe Islamisk Stat, har taget skylden for en af mindst to raketter, der fredag aften blev affyret mod det sydlige Israel.
En af raketterne ramte en bus i en by. En anden blev skudt ned af et israelsk forsvarssystem.
Fredag blev tre israelske betjente såret af en brandbombe, og politiet skød med gummikugler og spredte tåregas mod palæstinensiske aktivister, som kastede sten ved Olivenbjerget øst for Jerusalem.