Hæren greb ind, da demonstranter nægtede at forlade Tahrir-pladsen i Kairo efter massiv protest fredag.
To mænd er døde af deres skudsår, efter Egyptens hær forsøgte at opløse en demonstration i Kairo natten til lørdag.
Det oplyser lægekilder til nyhedsbureauet Reuters. De tilføjer, at de to er blandt 15, der er såret af skud.
Lyden af skud rungede på Tahrir-pladsen i det centrale Kairo i løbet af natten, og flere demonstranter søgte tilflugt i en nærliggende moské.
Nogle af dem fremviste lørdag morgen brugte patronhylstre som bevis på, at der var blevet skudt med skarpt. En talsmand for hæren siger imidlertid, at soldaterne kun affyrede skud med løst krudt.
Det er ikke umiddelbart klart, om der var andre bevæbnede personer på pladsen end soldaterne.
Ifølge demonstranterne brugte hæren elektriske stave og affyrede varselsskud op i luften for at sprede hundredvis af demonstranter, der lørdag morgen stadig var samlet på pladsen.
Demonstranterne siger, at de vil fortsætte deres protester, indtil deres krav bliver opfyldt, heriblandt at den afsatte præsident Hosni Mubarak stilles for en domstol.
I vrede over soldaternes brug af magt kastede demonstranterne sten og satte ild til i alt tre af hærens køretøjer.
Fredag var hundredtusinder samlet i det centrale Kairo til den største demonstration i en måned.
Da udgangsforbuddet trådte i kraft klokken 02, omringede hæren de tilbageværende demonstranter i et forsøg på at presse dem ud fra pladsen.
Generelt er der bred opbakning i den egyptiske befolkning til militæret, men samtidig lyder der stigende utilfredshed med det midlertidige militære styre.
I den seneste tid har demonstranter ytret kritik af, at det går for langsomt med at stille Mubarak og hans nærmeste til ansvar for magtmisbrug, korruption og for angiveligt at have ført milliardbeløb ud af landet.
/ritzau/Reuters